Die genannten Gruppen von Nervenzellen kommunizieren über Botenstoffe (Neurotransmitter) und Hormone miteinander. Die Formatio reticularis erregt den Thalamus über die Botenstoffe Noradrenalin (NA) und Acetylcholin (ACh); wir werden munter. Über einen anderer Transmitterstoff, nämlich GABA, wirkt sie bremsend auf die Aktivität des Thalamus, so dass wir müde werden; auch der Transmitterstoff Serotonin spielt beim Einschlafen eine wichtige Rolle.
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